Det är den fjärde branden på lika många år och den senaste ledde till att produktionen fick stå still i några timmar, rapporterar CNBC.
I ett internt brev som affärskanalen fått ta del av anklagar Elon Musk en sabotör för att ligga bakom problemen.
Och problemen gäller inte bara bränderna i fabriken. Någon ska också ha orsakat betydande skada genom att ändra koder på en intern produkt och genom att dela data med externa personer.
I brevet uppmanar Elon Musk därför de anställda att framöver vara på sin vakt och reagera på allt som skulle kunna tyda på potentiellt sabotage av någon.
”Snälla var uppmärksamma på allt som inte ligger i företagets bästa intresse” sade Elon Musk medan han refererade den tidigare Intel-chefen Andy Groves kända uttalande om att ”bara de paranoida överlever”.