Det rapporterar nyhetsbyrån ANP med hänvisning till ett internt mejl, enligt Reuters.
Kontoret kommer att vara stängt på måndag och tisdag för att rengöras. Den anställde har fått hemisolering på 14 dagar, enligt bolaget.
Nike har cirka 2 000 anställda som jobbar på huvudkontoret.
Nederländerna har sedan slutet av februari identifierat tio insjukningar med viruset.
Nike stänger det europeiska huvudkontoret efter coronafall
Finwire / Breakit
Sportutrustningsjätten Nike stänger temporärt sitt europeiska huvudkontor i Nederländerna sedan en anställd fått coronaviruset.
Dela på Facebook
Dela på Twitter
Dela på LinkedIn
Finwire / Breakit
Läs mer