Det rapporterar Bloomberg News med hänvisning till källor.
Enligt uppgiftslämnarna har kommissionen skickat ut frågeformulär till bolagets kunder och rivaler om en rad metoder. Företagen har till nästa vecka på sig att skicka in svaren.
Det som enligt uppgift intresserar EU:s myndighetspersoner är om Facebook använder sin storlek för att driva ut mindre rivaler. Bolagets säljplattform är i fokus liksom insamlingen och delningen av data från appar, sade en av källorna.
Facebook har blivit något av en slagpåse med europeiska regulatorer sedan man låtit mängder av användardata delas med Cambridge Analytica, ett företag som påverkar politiska val. Bolaget var anlitat av bland annat Donald Trump under presidentkampanjen 2016 och gick i konkurs förra året på dataskandalen.